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 大鸨 发表于: 2022-4-28 10:49:00|显示全部楼层|阅读模式

[2022年] 科学家开发一种通过小规模测序检测癌症DNA的新方法

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源自:科技部网站
  癌症患者的肿瘤细胞会释放部分DNA片段到血液中,这些来自肿瘤组织的DNA片段会携带突变。在临床样本中发现罕见的DNA突变,对于生物医学和诊断学等领域均有重要的意义。但精确地检测低丰度DNA难度大,特别是在寻找癌症治疗后留下的少量肿瘤细胞方面(称为“微小残留病”,或MRD,minimal residual disease),目前的技术需要通过大量测序才能找到。因此,亟需开发新的方法,提高检测灵敏度,降低检测成本。
  近日,美国麻省理工学院和哈佛大学的研究团队在《Nature Biomedical Engineering》杂志上发表题为“Massively parallel enrichment of low-frequency alleles enables duplex sequencing at low depth”的文章,开发了一种名为“通过识别寡核苷酸富集次要等位基因测序”的新方法MAESTRO(minor allele enriched sequencing through recognition oligonucleotides),能以较小的测序规模,准确、高效地从患者血液样本中识别出数千个DNA突变,有望以更低的成本协助检测患者体内的残存癌细胞,及时开展疾病复发监测。
  该研究中,研究人员首先对患者的肿瘤活检进行测序,了解突变的情况。根据突变信息,针对性的开发出仅与肿瘤相关的DNA序列结合的分子探针,用以富集血液样本中游离的肿瘤相关DNA,优化测序样本,提升从血液样本中识别出罕见癌症突变的能力。
  在检测数百个低丰度突变的测试中,与传统测序方法相比,MAESTRO方法在保证能发现大多数突变的同时,所需的资源更少。同时,MAESTRO方法还以较低的成本将搜索范围扩大到1万个突变,极大地提高了检测效率。研究团队利用MAESTRO方法,重新检测分析一批传统方法检测过的患者样本,从中检出了更多的突变。MAESTRO方法在单一检测方案中结合了深度和广度的优势,使更早检测MRD成为可能,甚至可能识别出血液中来自癌细胞的循环DNA。
  论文链接:
  https://www.nature.com/articles/s41551-022-00855-9

※ 注释
  此研究成果摘自《Nature Biomedical Engineering》杂志,文章内容并不代表本网站的观点和立场,仅供参考。
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